Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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MTMR3Q13615 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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MTMR3Q13615 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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