Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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