Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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