Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms