Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB28P51157 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB28P51157 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB28P51157 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms