Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms