Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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