Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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PRKCHP24723 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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PRKCHP24723 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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