Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms