Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDY1Q9Y6F8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDY1Q9Y6F8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDY1Q9Y6F8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms