Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX11Q9Y5W9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX11Q9Y5W9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms