Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMACHCQ9Y4U1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms