Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFE2L3Q9Y4A8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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