Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3V2

RWDD3, RWD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD3Q9Y3V2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD3Q9Y3V2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RWDD3Q9Y3V2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RWDD3Q9Y3V2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms