Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM50BQ9Y247 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms