Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNRGQ9UMZ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms