Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMFRQ9UKV5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms