Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO4Q9UKT5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms