Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX4Q9UIU6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SIX4Q9UIU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIX4Q9UIU6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms