Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP25Q9UHP3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP25Q9UHP3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms