Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP4Q9UGJ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP4Q9UGJ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms