Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNAL1Q9UBT7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms