Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N5

RBM27, RNA-binding protein 27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM27Q9P2N5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM27Q9P2N5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM27Q9P2N5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms