Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC49.72■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC49.72■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC49.72■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC49.71■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC49.71■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC49.68■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC49.66■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC49.64■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
CCDC180Q9P1Z9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC49.62■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC49.61■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC49.58■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.58■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC49.57■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.57■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC49.56■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC49.54■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC49.54■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.52■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC49.52■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.52■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC49.52■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.51■■■■■ 5.52
CCDC180Q9P1Z9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC49.49■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.48■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.47■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.44■■■■■ 5.51
CCDC180Q9P1Z9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC49.42■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC49.42■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.41■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
CCDC180Q9P1Z9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC49.37■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC49.36■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC49.36■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.36■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC49.35■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.35■■■■■ 5.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms