Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms