Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALKBH4Q9NXW9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms