Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIC8BQ9NVN3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIC8BQ9NVN3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIC8BQ9NVN3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms