Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC3Q9NUV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTLC3Q9NUV7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms