Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms