Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER3Q9NSC5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms