Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT84Q9NSB2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms