Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
DUOX2Q9NRD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DUOX2Q9NRD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
DUOX2Q9NRD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
DUOX2Q9NRD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
DUOX2Q9NRD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
DUOX2Q9NRD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
DUOX2Q9NRD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DUOX2Q9NRD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms