Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINT3Q9NQE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HINT3Q9NQE9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms