Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD3Q9NPG1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms