Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP25Q9NPA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP25Q9NPA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP25Q9NPA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP25Q9NPA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP25Q9NPA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP25Q9NPA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP25Q9NPA2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP25Q9NPA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms