Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRM3Q9NNZ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms