Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POPDC3Q9HBV1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC3Q9HBV1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms