Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRAGCQ9HB90 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRAGCQ9HB90 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRAGCQ9HB90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRAGCQ9HB90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRAGCQ9HB90 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRAGCQ9HB90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRAGCQ9HB90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGCQ9HB90 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRAGCQ9HB90 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms