Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVMER34-1Q9H9K5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms