Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A3Q9H7F0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP13A3Q9H7F0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A3Q9H7F0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms