Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXO5Q9H790 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXO5Q9H790 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms