Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SH2D4AQ9H788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH2D4AQ9H788 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms