Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF41Q9H4P4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RNF41Q9H4P4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms