Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA6BQ9H3T3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA6BQ9H3T3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA6BQ9H3T3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms