Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF39Q9H2S5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF39Q9H2S5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms