Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDGFDQ9GZP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDGFDQ9GZP0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDGFDQ9GZP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
PDGFDQ9GZP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDGFDQ9GZP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDGFDQ9GZP0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PDGFDQ9GZP0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDGFDQ9GZP0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDGFDQ9GZP0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDGFDQ9GZP0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDGFDQ9GZP0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDGFDQ9GZP0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms