Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms