Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHE41Q9C0J9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms