Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms