Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPEF2Q9C093 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms